Untuk melihat MySQL versi berapa, jalankan perintah ini :
# rpm -qa | grep -i mysql-

Misal versinya adalah 5, lalu akan dirubah jadi versi 4.1. Backup dulu file /var/lib/mysql :
# cp /var/lib/mysql /var/lib/mysql.old

Edit file /var/cpanel/cpanel.config :
# vi /var/cpanel/cpanel.config

Cari baris mysql-version=5.0 dan ganti jadi mysql-version=4.1

Save file tersebut :
:wq!

Lalu jalankan perintah ini :
# /scripts/mysqlup –force

Kalau sudah selesai, lihat lagi versi MySQL dengan menjalankan perintah ini lagi :
# rpm -qa | grep -i mysql-

Seharusnya MySQL versi 5 tadi sudah berubah jadi MySQL versi 4.1

Sumber